Деятельность семинара в 2015 году — Федеральный исследовательский центр

Февраль

Представление диссертаций на соискание ученой степени кандидата биологических наук

Чепелева Елена Васильевна, аспирант ИЦиГ СО РАН (окончание аспирантуры)

Тема: «Характеристика регенеративного потенциала культур кардиоваскулярных клеток, полученных из эксплантов сердечной мышцы человека и крысы»

Научный руководитель: д.б.н., проф. Закиян Сурен Минасович, зав. лаб. эпигенетики развития ИЦиГ СО РАН

Рецензенты:

д.м.н., профессор Лифшиц Галина Израилевна, зав. лаб. персонализированной медицины ЦНМТ ИХБФМ СО РАН;

к.м.н. Повещенко Ольга Владимировна, зав. лаб. клеточных технологий НИИКЭЛ;

к.б.н. Баттулин Нариман Рашитович, зав. сектором геномики стволовых клеток ИЦиГ СО РАН.

Ахметова Катарина Артемовна, м.н.с. сект. генетики клеточного цикла ИЦиГ СО РАН

Тема: «Структура и функции септина, кодируемого геном peanut Drosophila melanogaster»

Научный руководитель: к.б.н. Федорова Светлана Александровна, зав. сект. генетики клеточного цикла ИЦиГ СО РАН

Рецензенты:

д.б.н. Похолкова Галина Витальевна, с.н.с. лаб. молекулярной цитогенетики ФГБУН ИМКБ СО РАН;

д.б.н. Москалев Алексей Александрович, зав. лаб. молекулярной радиобиологии и геронтологии ФГБУН Институт биологии Коми научного центра Уральского отделения РАН, г. Сыктывкар.

Презентация

Лавреха Виктория Вадимовна, аспирант ИЦиГ СО РАН (окончание аспирантуры)

Тема: «Математическое моделирование формирования и поддержания ниши стволовых клеток в апикальной меристеме корня Arabidopsis thaliana L.»

Научный руководитель: акад. РАН, д.б.н., Колчанов Николай Александрович, зав. отд. системной биологии, Директор ИЦиГ СО РАН

Рецензенты:

к.б.н. Дорошков Алексей Владимирович, ИЦиГ СО РАН

к.б.н. Лашин Сергей Александрович, ИЦиГ СО РАН

Апрель

Утверждение тем кандидатских диссертаций

Иванисенко Никита Владимирович

Тема: «Математическое моделирование ингибирования репликации вируса гепатита С»

Научный руководитель: акад. РАН, профессор Колчанов Н.А.

Попик Ольга Васильевна

Тема: «Математическое моделирование взаимодействий между молекулярно-генетическими системами на основе данных возмущения элементов этих систем»

к.б.н., доцент Иванисенко В.А.

Вялкова Анна Викторовна

Тема: «Создание модели синдрома удлиненного интервала QT при помощи индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека»

Научный руководитель: д.б.н., профессор Закиян С.М.

Смирнов Александр Васильевич

Тема: «Экспрессия гена человека hGM-CSF под эндогенным промотором альфа-S1-казеина в геноме мыши»

Научный руководитель: д.б.н., профессор Серов Олег Леонидович

Научный доклад

к.б.н. Федорова Нина Борисовна, н.с. лаб. механизмов клеточной дифференцировки ИЦиГ СО РАН

«Стратегия дальнейшего исследования условных мутаций у дрозофилы»

Замена научного руководителя кандидатской диссертации

по просьбе научного руководителя акад. РАН, профессора, директора ИЦиг СО РАН Колчанова Н.А.

для кандидатской диссертации м.н.с. межинститутского сектора высокопроизводительных вычислений в биоинформатике Алемасова Николая Александровича «Использование спецпроцессоров для изучения физических свойств белков методами молекулярной динамики»

Назначен новый научный руководитель: к.б.н., доцент Иванисенко В.А.

Май

Утверждение тем докторских диссертаций

к.б.н. Стефанова Наталья Анатольевна

Тема: Механизмы развития признаков болезни Альцгеймера у крыс OXYS и влияние на него митохондриального антиоксиданта SkQ1

Научный консультант: д.б.н., профессор Колосова Наталия Гориславовна, зав. сектором молекулярных механизмов старения ИЦиГ СО РАН

к.б.н. Лашин Сергей Александрович

Тема: Многоуровневые модели эволюционных процессов

Научный консультант: академик РАН, д.б.н., профессор Колчанов Николай Александрович, зав. отделом системной биологии, директор ИЦиГ СО РАН.

Утверждение тем кандидатских диссертаций

Телегина Дарья Викторовна, аспирант 2-го года обучения ИЦиГ СО РАН

Тема: Молекулярные механизмы гибели клеток в сетчатке крыс при старении и развитии ретинопатии

Научный руководитель: д.б.н., профессор Колосова Наталия Гориславовна, зав. сектором молекулярных механизмов старения ИЦиГ СО РАН

Рудницкая Екатерина Александровна, аспирант 2-го года обучения ИЦиГ СО РАН

Тема: Содержание нейротрофических факторов в мозге при преждевременном старении и его коррекции антиоксидантами

Витовтов Антон Олегович, аспирант 2-го года обучения ИЦиГ СО РАН

Тема: Консервативный mTOR-сигнальный путь как мишень для профилактики преждевременного старения мозга

Представление диссертаций на соискание ученой степени кандидата биологических наук

Новоселова Екатерина Сергеевна, старший лаборант-исследователь лаб. молекулярно-генетических систем ИЦиГ СО РАН

Тема: «Математическое моделирование транспорта ауксина в инициальных клетках сосудистой системы корня»

Научный руководитель: д.б.н., доцент Лихошвай Виталий Александрович, в.н.с. лаб. молекулярно-генетических систем ИЦиГ СО РАН

Рецензенты:

к.б.н. Акбердин Илья Ринатович, ИЦиГ СО РАН;

к.б.н. Дорошков Алексей Владимирович, ИЦиГ СО РАН.

Презентация

Июнь

Изменение названия кандидатской диссертации

Тема кандидатской диссертации Соколова Владимира Сергеевича м.н.с. лаб. молекулярно-генетических систем ИЦиГ СО РАН

«Компьютерное исследование особенностей элонгации трансляции у одноклеточных»

Меняется на

«Компьютерное исследование особенностей открытых рамок считывания, потенциально связанных с эффективностью элонгации трансляции, у одноклеточных»

Научный руководитель: к.б.н., доцент Матушкин Юрий Георгиевич, зав. лаб. молекулярно-генетических систем ИЦиГ СО РАН.

Утверждение темы докторской диссертации

к.б.н. Левицкий Виктор Георгиевич

Тема: Компьютерный анализ сайтов связывания транскрипционных факторов и

нуклеосомной организации геномной ДНК на основе полногеномных экспериментальных данных

Представление диссертации на соискание ученой степени доктора биологических наук

к.б.н. Стефанова Наталья Анатольевна, научный сотрудник сектора молекулярных механизмов старения ИЦиГ СО РАН

Тема: «Механизмы развития признаков болезни Альцгеймера у крыс OXYS и оценка нейропротекторного потенциала митохондриального антиоксиданта SkQ1»

Рецензенты:

д.б.н. Онуфриев Михаил Валерьевич, ФГБУН Институт высшей нервной деятельности и нейрофизиологии РАН, г. Москва;

д.б.н. Ратушняк Александр Савельевич, ФГБУН Конструкторско-технологический институт вычислительной техники СО РАН, г. Новосибирск;

д.б.н., профессор Мошкин Михаил Павлович, ИЦиГ СО РАН, г. Новосибирск.

Представление диссертаций на соискание ученой степени кандидата биологических наук

Иванисенко Никита Владимирович, аспирант 3-го года обучения ИЦиГ СО РАН (окончание аспирантуры)

Тема: «Компьютерное моделирование ингибирования репликации вируса гепатита»

Научный руководитель: Акад. РАН, д.б.н., проф. Колчанов Николай Александрович, зав. отд. системной биологии, Директор ИЦиГ СО РАН.

Рецензенты:

д.б.н., доцент Орлов Юрий Львович, ИЦиГ СО РАН;

к.б.н. Лашин Сергей Александрович, ИЦиГ СО РАН

Соколов Владимир Сергеевич, м.н.с. лаб. молекулярно-генетических систем ИЦиГ СО РАН

Тема: «Компьютерное исследование особенностей открытых рамок считывания, потенциально связанных с эффективностью элонгации трансляции, у одноклеточных»

Научный руководитель: к.б.н., доцент Матушкин Юрий Георгиевич, зав. лаб. молекулярно-генетических систем ИЦиГ СО РАН

Рецензенты:

д.б.н., доцент Кочетов Алексей Владимирович, ИЦиГ СО РАН;

к.б.н., доцент Афонников Дмитрий Аркадьевич, ИЦиГ СО РАН

Презентация

Июль

Утверждение тем кандидатских диссертаций

Аркова Ольга Владимировна

Тема: «Изучение потенциально функционально значимых полиморфизмов ТАТА-боксов промоторов генов липидного метаболизма человека»

Научный руководитель: к.б.н. Савинкова Людмила Кузьминична, зав. сектором мол-генет. механизмов белок-нуклеиновых взаимодействий ИЦиГ СО РАН.

Демидова Елизавета Вячеславовна

Предполагаемая научная специальность: 03.02.07 — генетика

Тема: «Изучение воздействия терагерцового излучения на Escherichia coli при помощи геносенсоров»

Научный руководитель: к.б.н. Сергей Евгеньевич Пельтек, зав. лаб. молекулярных биотехнологий, зам. директора ИЦиГ СО РАН по научной работе.

Мещерякова Ирина Анатольевна

Тема: «Исследование протеомного ответа E. coli на нетермическое воздействие терагерцового излучения»

Утверждение темы докторской диссертации

к.б.н. Афонников Дмитрий Аркадьевич

Тема: «Компьютерный анализ механизмов адаптации организмов к изменяющимся условиям среды на фенотипическом, геномном и молекулярном уровне»

Научный консультант: акад. РАН, д.б.н., профессор Колчанов Николай Александрович, зав. отделом системной биологии, Директор ИЦиГ СО РАН.

Сентябрь

Представление диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук

Корболина Елена Евгеньевна, м.н.с. сектора молекулярных механизмов старения ИЦиГ СО РАН

Тема: «Выявление молекулярных механизмов развития ранних нейродегенеративных изменений и катаракты у крыс OXYS с использованием конгенных линий крыс»

Научный руководитель: д.б.н., проф. Колосова Наталия Гориславовна, зав. сект. молекулярных механизмов старения ИЦиГ СО РАН.

Рецензенты:

д.б.н., проф. Дымшиц Григорий Моисеевич, НГУ;

д.б.н. Омельянчук Леонид Владимирович, ИМКБ СО РАН

Презентация

Октябрь

Представление диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук

Попик Ольга Васильевна, аспирант 3-го года обучения ИЦиГ СО РАН (окончание аспирантуры)

Тема: «Математическое моделирование взаимодействий между вирусом гепатита С и TNF-индуцированным сигнальным путём»

Научный руководитель: к.б.н., доцент Иванисенко Владимир Александрович, зав. лаб. заведующий лабораторией компьютерной протеомики ИЦиГ СО РАН.

Рецензенты:

д.б.н., Орлов Юрий Львович, ИЦиГ СО РАН;

д.б.н., профессор Голубятников Владимир Петрович, Институт математики им. С. Л. Соболева СО РАН

Научный доклад

Dr. Lennart Karssen:

«Omics data analysis: computational infrastructure and data stewardship»

Декабрь

Утверждение темы докторской диссертации

к.б.н. Баричева Элина Михайловна, зав. лаб. механизмов клеточной дифференцировки ИЦиГ СО РАН.

Тема: Ген Trithorax-like Drosophila melanogaster, его экспрессия и роль в онтогенезе.

Специальность: 03.03.04 – клеточная биология, цитология, гистология.

Научный консультант: д.б.н., профессор Меркулова Татьяна Ивановна, зав. отд. молекулярной генетики ИЦиГ СО РАН.

Представление диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук

Зубаирова Ульяна Станиславовна, м.н.с. лаб. биоинформатики ИЦиГ СО РАН.

Тема: «Компьютерное моделирование морфодинамики в меристемах растений с учётом морфогенетической регуляции и биомеханических свойств клеток»

По просьбе научного руководителя акад. РАН, д.б.н., профессора, Директора ИЦиГ СО РАН Колчанова Николая Александровича, произведена замена научного руководителя.

Новый научный руководитель: к.б.н. Николаев Сергей Васильевич, н.с. лаб. эволюционной биоинформатики и теоретической генетики ИЦиГ СО РАН.

Презентация