Общие сведения
Алексей Владимирович Кочетов
академик РАН, директор ИЦиГ СО РАН
Информация об Институте
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук» (ИЦиГ СО РАН)
Кадровый состав
В настоящее время ФИЦ ИЦиГ СО РАН включает три филиала:
- • Сибирский научно-исследовательский институт растениеводства и селекции (СибНИИРС),
- • Научно-исследовательский институт клинической и экспериментальной лимфологии (НИИКЭЛ),
- • Научно-исследовательский институт терапии и профилактической медицины (НИИТПМ).
На 1 января 2023 года структура ФИЦ ИЦиГ СО РАН состояла из 139 научных подразделений, в которых работали 1469 человек, в том числе 467 научных сотрудника, из них 45% сотрудников в возрасте до 39 лет; 10 членов РАН, 93 доктора наук, 283 кандидата наук.
Научные направления ИЦиГ СО РАН
- Молекулярная и общая генетика человека, животных и растений; структурно-функциональная организация генома, протеома и хромосом; реконструкция геномов, трансгенез у животных и растений; механизмы реализации генетической информации, биоинформатика, биотехнология и нанобиотехнология, биоинженерия и нанобиоинженерия, микробиология.
- Клеточная биология, теоретические основы клеточных технологий; молекулярные основы иммунитета и онкогенеза; хромосомо- и генодиагностика наследственных и мультифакторных заболеваний; фармакология.
- Фундаментальные медико-биологические исследования; разработка на основе современных методов биоинформатики, молекулярной и клеточной биологии подходов к выявлению новых фармакологических мишеней и созданию лечебных препаратов нового поколения; разработка новых технологий доклинических исследований и доклинические испытания препаратов; разработка методов ранней диагностики и диагностических средств.
- Биология развития и эволюция живых систем; генетические и генетико-эволюционные основы функционирования физиологических систем, обеспечивающих важнейшие процессы жизнедеятельности.
- Популяционно-генетические, экологические и эволюционные основы биоразнообразия; разработка новых методов генетики и селекции животных и растений для эффективного использования их генофондов. Институту цитологии и генетики СО РАН принадлежат лидерские позиции в российской и мировой науке по ряду актуальных направлений генетики, селекции, клеточной и молекулярной биологии, эволюционной и физиологической генетики, системной биологии, биотехнологии, биоинформатики и биомедицины, обусловленные наличием уникальных компетенций.
Направления деятельности филиалов
НИИТПМ
Изучение молекулярно-биологических, организменных и популяционных закономерностей формирования хронических неинфекционных заболеваний и их особенностей у населения Сибири, разработка научных основ их профилактики, диагностики и лечения
НИИКЭЛ
Проведение фундаментальных, поисковых и прикладных (в том числе клинических) исследований по следующим направлениям:
- • изучение молекулярной и клеточной организации, генетических основ и регуляции функционирования лимфатической системы, лимфоидных образований и системы рыхлой соединительной ткани в организме человека;
- • изучение молекулярных механизмов, выявление геномных и постгеномных маркеров, разработка новых подходов к коррекции ремоделирования кровеносных и лимфатических сосудов, ангиогенеза и лимфангиогенеза при аутоиммунных, эндокринных, сердечно-сосудистых заболеваниях, злокачественных новообразованиях, патологии соединительной ткани;
- • разработка новых биомедицинских клеточных и тканеинженерных продуктов на основе стволовых/ Направления деятельности филиалов прогениторных клеток для стимуляции регенерации поврежденных ишемизированных и дегенеративных тканей и органов;
- • разработка новых технологий диагностики, прогноза, профилактики, лечения и реабилитации заболеваний человека, связанных с нарушениями функционирования лимфатической, иммунной, эндокринной систем и соединительной ткани;
- • разработка, изучение эффективности и безопасности новых лекарственных препаратов.
СибНИИРС
Основные научные направления деятельности соответствуют разделу «Генетическая платформа для решения задач селекции растений: фундаментальные исследования и прикладные разработки» и включают:
- • растениеводство; поиск, мобилизация и сохранение сибирского генетического ресурса растений, создание новых сортов сельскохозяйственных культур, разработка сортовых технологий возделывания растений, оптимизация элементов технологии семеноводства и питомниководства;
- • сбор, сохранение, описание и генетическая паспортизация по белковым маркерам растений для генетических коллекций ФИЦ ИЦиГ СО РАН, в том числе различных видов пшениц и других злаковых, зернобобовых, овощных, лесных и садовых культур;
- • создание и изучение гибридных форм зерновых и зернобобовых растений с использованием доноров новых генов устойчивости к абиотическим и биотическим факторам внешней среды;
- • получение и изучение новых гибридных форм овощных культур и картофеля, созданных на основе привлечения в гибридизацию генетически разнокачественного материала, включающего адаптивные сорта, перспективные селекционные формы местного ассортимента, а также доноры хозяйственно ценных признаков;
- • разработка сортовых агротехнологий выращивания полевых, зернобобовых, овощных и технических культур. Производство в питомниках первичного семеноводства оригинальных семян сортов собственной селекции.
Компетенции
В ИЦиГ СО РАН проводят научные исследования по широкому кругу актуальных направлений генетики, селекции, клеточной и молекулярной биологии, системной биологии и биоинформатике, биотехнологии и биомедицине, основанные на высоком уровне компетенций и научных школах, заложенных основателями Института.
- Генетика и селекция растений.
Применение генетических технологий: отдаленной гибридизации, маркер-ориентированной селекции, геномной селекции, получение дигаплоидов – позволяет значительно повысить эффективность разработки новых сортов сельскохозяйственных растений. Коллективом ФИЦ созданы новые генетические линии на основе пшенично-ржаных, пшенично-пырейных гибридов и синтетических форм пшениц, разработаны десятки новых генетических маркеров, позволяющих отбирать линии растений с устойчивостью к патогенам и заданной длиной вегетационного периода. В целом, создано более 167 сортов зерновых сельскохозяйственных культур, включенных в Госреестр селекционных достижений, возделываемых в 23 субъектах РФ на площади более 3 млн га и занимающих лидирующие позиции в рейтинге Россельхозцентра (яровая мягкая пшеница, ячмень, тритикале и т. д.). С 2019 года ИЦиГ СО РАН вошел в состав ЦГИМУ «Курчатовский геномный центр», к основным направлениям деятельности которого относятся разработки генетических технологий для сельского хозяйства и биотехнологической промышленности. В рамках этой работы в ФИЦ отсеквенированы пангеномы российских сортов ячменя и картофеля, а также геном сорта мягкой пшеницы «Саратовская 29», создана генетическая платформа для селекции сельскохозяйственных растений, включающая в том числе технологии геномного редактирования ячменя, пшеницы и картофеля. Совместно с индустриальными партнерами формируются проекты по производству целлюлозы и продуктов ее переработки на основе оригинального сорта мискантус «Сорановский» с высоким содержанием целлюлозы и низким уровнем лигнина (около 17%).
- Генетика и селекция животных.
Одно из традиционных направлений деятельности ИЦиГ СО РАН – разработка линий лабораторных животных – генетических моделей заболеваний человека. Получен набор моделей по широкому спектру патологий: ожирение, преждевременное старение, болезнь Альцгеймера, гипертония, патологии поведения и т. д. В ИЦиГ СО РАН создана уникальная научная установка SPF-виварий, оборудованная высокотехнологичными приборами для исследования лабораторных животных: МРТ-томограф, отслеживание поведения, снятие физиологических характеристик, аккредитована GLP-лаборатория неклинических исследований для разработки фармпрепаратов. Генетические линии мышей и крыс широко используют для получения фундаментальных знаний о генетическом контроле физиологических процессов и механизмах возникновения и развития социально значимых патологий. Отдельно следует отметить моделирование эволюционных процессов: эксперимент Д.К. Беляева по доместикации лисиц считается одним из наиболее масштабных генетических экспериментов XX века. Исследование доместицированных линий лис, норок и крыс открывает уникальные возможности для изучения молекулярно-генетического контроля поведения. В области исследования генетики и геномики сельскохозяйственных животных в ИЦиГ сформирован генетический банк образцов российских пород крупного рогатого скота, ведется активная работа в рамках международных консорциумов, обнаружен ряд генетических полиморфизмов, ассоциированных с физиологическими и морфологическими характеристиками крупного рогатого скота.
- Молекулярная и общая генетика человека.
Собран банк ДНК человека – ядерной и митохондриальной ДНК народонаселения Сибири, проводится поиск и апробация на российских популяциях ДНКмаркеров, коррелирующих с риском развития патологических состояний. Большое внимание уделяется исследованию генетической предрасположенности к мультифакторным заболеваниям с использованием полногеномного анализа ассоциаций, а также разработке клеточных пациент-специфичных моделей патологий человека с помощью индуцированных плюрипотентных стволовых клеток и направленной дифференцировки как инструментам персонифицированной медицины и фармакологии. Ведется активная совместная работа с археологами в области палеогенетики человека, направленная на реконструкцию эволюции молекулярно-генетических систем, анализ популяционно-генетических особенностей и направлений палеомиграции.
- Биотехнология.
Собрана биоресурсная коллекция микроорганизмов-экстремофилов (более 2500 штаммов), геномы которых были отсеквенированы в рамках программы развития Центра геномных исследований мирового уровня «Курчатовский геномный центр ИЦиГ СО РАН». Разработан конвейер для определения метаболических характеристик штаммов и создания рекомбинантных штаммов-суперпродуцентов белков на основе метилотрофных дрожжей. Исследование структурно-функциональной организации геномов микроорганизмов из мест обитания: горячих источников, соленых озер, мусорных полигонов, сточных вод различных производств – не только позволяет получать новые знания в области молекулярной эволюции, но и находить ценные ресурсы для промышленности. Совместно с индустриальными партнерами получен и внедряется ряд супепродуцентов ферментов для пищевой и кормовой промышленности, производства синтетических моющих средств и так далее.
- Молекулярная генетика и клеточная биология.
Направления исследований и компетенции ИЦиГ СО РАН основаны на ЦКП микроскопии биологических объектов (конфокальные, электронные микроскопы, клеточные сортеры и т. д.) и геномных технологий (линейка секвенаторов). В центре внимания – реконструкция 3D-структуры генома, эволюция на уровне организации хромосом, патологии развития человека и животных, омиксные данные, работы на клеточных линиях животных, включая репродуктивные технологии сохранения редких видов животных. Одна из основных задач молекулярной генетики – структурно-функциональная организация генов и геномов, что относится и к регуляторным участкам – промоторы, сайты связывания транскрипционных факторов и регуляторные SNP, регуляция сплайсинга, посттранкрипционный контроль на уровне трансляции мРНК.
- Биоинформатика и системная компьютерная биология.
Высокий уровень компетенций в разработке для биоинформационной поддержки экспериментальных исследований в генетике человека, животных, растений, микроорганизмов и молекулярных биотехнологиях, включая создание баз данных и программного обеспечения для: а) высокопроизводительного компьютерного анализа больших объемов экспериментальных данных, получаемых методами геномики, транскриптомики, протеомики и метаболомики; б) получения новых знаний об организации сложных молекулярно-генетических систем; в) компьютерной реконструкции, анализа и моделирования генных сетей, контролирующих клеточный метаболизм человека, животных и микроорганизмов и процессы развития тканей растений; г) компьютерного поиска новых фармакологических мишеней в биологических макромолекулах; д) доступа к распределенным мировым информационным ресурсам в области геномики, транскриптомики, протеомики, метаболомики, общей и молекулярной генетики, клеточной биологии, физиологии, фармакологии, биомедицины, биотехнологии, агробиотехнологии.
Стратегическая цель и задачи
Стратегическая цель ИЦиГ СО РАН – получение новых знаний в области генетики и клеточной биологии, разработка и применение генетических технологий для решения приоритетных задач развития научно-технологического комплекса Российской Федерации.
Приоритетные задачи ИЦиГ СО РАН: получение новых фундаментальных знаний в области общей и молекулярной генетики и клеточной биологии; разработка и внедрение генетических технологий для агропромышленного комплекса, медицины и биотехнологии.
Позиционирование ИЦиГ СО РАН осуществляется по следующим направлениям: достижение результатов, обеспечивающих технологический суверенитет и конкурентные позиции Российской Федерации в стратегически важных для государства областях, включая генетические технологии для медицины, фармакологии, биотехнологической промышленности и сельского хозяйства.
В своей деятельности ИЦиГ СО РАН руководствуется приоритетами развития Российской Федерации и Новосибирской области, изложенными в следующих документах:
- • Указ Президента Российской Федерации от 07.05.2018 № 204 «О национальных целях и стратегических задачах развития Российской Федерации на период до 2024 года» (указом поставлена задача по созданию к 2024 году научных центров мирового уровня, включая сеть международных математических центров и центров геномных исследований);
- • Программа фундаментальных научных исследований в Российской Федерации на долгосрочный период (2021–2030 годы), утвержденная Распоряжением Правительства РФ от 31.12.2020 № 3684-р;
- • Постановление Правительства Российской Федерации от 22.04.2019 № 479 «Об утверждении Федеральной научно-технической программы развития генетических технологий на 2019–2027 годы»;
- • Указ Президента Российской Федерации от 01.12.2016 № 642 (в редакции от 15.03.2021) о Стратегии научно-технологического развития Российской Федерации до 2035 года;
- • Указ Президента Российской Федерации от 21.07.2016 № 350 (в редакции от 03.12.2021) «О мерах по реализации государственной научно-технической политики в интересах развития сельского хозяйства»;
- • Федеральная научно-техническая программа развития сельского хозяйства на 2017–2025 годы (Постановление Правительства РФ от 25.08.2017 № 996);
- • Стратегия развития фармацевтической промышленности РФ на период до 2030 года (Постановление Правительства РФ от 15.04.2014 № 305, в редакции Постановления Правительства РФ от 29.12.2021 № 2544);
- • Доктрина продовольственной безопасности РФ, утвержденной Указом Президента РФ от 21.01.2020 № 20.
Проекты и гранты
Государственное задание
Фундаментальные и поисковые исследования – всего 34 темы (2020 год – 24 темы, 2021 год – 30 тем), в том числе:
- • 7 тем – НИИКЭЛ – филиал ИЦиГ СО РАН
- • 4 темы – НИИТПМ – филиал ИЦиГ СО РАН
- • 4 темы – СибНИИРС– филиал ИЦиГ СО РАН
- • 19 тем – ИЦиГ СО РАН, включая: 5 тем – медицинские КПНИ, 1 проект КПНИ «Развитие селекции и семеноводства картофеля»
- • 13 тем – «молодежные» лаборатории
Гранты
55 проектов РНФ, из них 8 проектов – филиалы ИЦиГ СО РАН (в 2022 году было 46 проектов)
Лицензии и сертификаты
Институт осуществляет медицинскую и образовательную деятельность в соответствии с лицензиям:
- Лицензия на осуществление медицинской деятельности.
- Выписка из реестра лицензий (22.07.2022).
- Уведомление о внесении изменений в реестр лицензий.
- Лицензия на осуществление образовательной деятельности.
- Выписка из реестра лицензий (06.07.2022).
- Распоряжение о внесении изменений в лицензию.
- Приказ Рособрнадзора о государственной аккредитации образовательной деятельности Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук» от 24.07.2019 № 1066.
- Свидетельство о государственной аккредитации (аспирантура, ординатура).
Институт имеет сертификаты:
«Центр неклинических испытаний (ЦНИ) на базе Центра генетических ресурсов лабораторных животных ИЦиГ СО РАН». Центру присвоен статус соответствия испытательной лаборатории (Центра) принципам надлежащей лабораторной практики. Министерство экономического развития Российской Федерации. Федеральная служба по аккредитации. Приказ № НЛП-21 от 20.11.2020.
В 2022 году Приказом Министерства сельского хозяйства РФ ИЦиГ СО РАН зарегистрирован в государственном племенном регистре в качестве лаборатории молекулярно-генетической экспертизы сельскохозяйственных животных. Такая экспертиза позволяет с высокой точностью контролировать достоверность происхождения племенного скота.