Программа распознавания функциональных сайтов в пространственных структурах белков и реконструкции молекулярных комплексов белков-лиганд (PDBSiteScan)

АВТОР

к.б.н. Иванисенко В.А.

ХАРАКТЕРИСТИКА

Программа предназначена для функциональной аннотации белковых молекул, реконструк-ции сетей белок-белковых и белок-лиганд взаимодействий. Программа позволяет распознавать функциональные сайты в пространственных структурах белков, включая: сайты каталитических центров ферментов, сайты посттрансляционных модификаций белков, сайты связывания ионов металлов, сайты связывания органических и неорганических лигандов, сайты связывания ДНК и РНК, а также восстанавливать пространственные структуры комплексов лигандов с активными сайтами белков.

Рис. 1 Молекулярный докинг иона и его сайта связывания в молекуле белка

ТЕХНИКО-ЭКОНОМИЧЕСКИЕ ПРЕИМУЩЕСТВА

Программа обеспечивает выявление функционально важных свойств структуры белков, не-обходимых для решения задач идентификации функции белков, поиска мишеней для лекарствен-ных препаратов и целенаправленного конструирования белков с улучшенными медико-биологическими свойствами, а также поиск и конструирование низкомолекулярных лигандов, способных связываться с активными центрами белков.

ОБЛАСТИ ПРИМЕНЕНИЯ

Программа может быть использована в области молекулярной биологии, медицины и био-технологии, а также других областях, связанных с изучением функционального строения белков и молекулярно-генетических систем.

УРОВЕНЬ ПРАКТИЧЕСКОЙ РЕАЛИЗАЦИИ

Программа использовалась для решения задачи поиска перспективных мишеней действия лекарственных препаратов, направленных против вируса гепатита С.

ПАТЕНТНАЯ ЗАЩИТА

Разработанная программа прошла официальную регистрацию № 2005612795.

КОММЕРЧЕСКИЕ ПРЕДЛОЖЕНИЯ

Лицензионное соглашение.

ОРИЕНТИРОВОЧНАЯ СТОИМОСТЬ

Лицензия — 20 000$ в год.

КОНТАКТНАЯ ИНФОРМАЦИЯ

Колчанов Николай Александрович
Зам.директора Института, член-корр.РАН
Институт цитологии и генетики СО РАН,
Просп.академика Лаврентьева,10, г.Новосибирск 630090
Тел.:(383)333-34-68; факс:(383)333-12-78
Email: kol@bionet.nsc.ru;
WWW: http://www.bionet.nsc.ru