База данных «Пространственные структуры функциональных сайтов белков (PDBSite)»

АВТОР Иванисенко В.А.

ХАРАКТЕРИСТИКА

База данных предназначена для функциональной аннотации белковых молекул, реконструкции сетей белок-белковых и белок-лиганд взаимодействий. База данных содержит информацию о пространственной структуре функциональных сайтов белков, включая: сайты каталитических центров ферментов, сайты пострансляционных модификаций белков, сайты связывания ионов металлов, сайты связывания органических и неорганических лигандов, сайты связывания бел-ков, ДНК и РНК.

Рис. 2 Молекулярный комплекс белков NS5B вируса гепатита С и NTF2 человека.

ТЕХНИКО-ЭКОНОМИЧЕСКИЕ ПРЕИМУЩЕСТВА

База данных обеспечивает пользователя информацией о функционально важных свойств структуры белков, необходимых для решения задач идентификации функции белков, поиска мишеней для лекарственных препаратов и целенаправленного конструирования белков с улучшенными медико-биологическими свойствами, а также о пространственных структурах комплексов лиганд-активный сайт.

ОБЛАСТИ ПРИМЕНЕНИЯ

База данных может быть использована в области молекулярной биологии, медицины и биотехнологии, а также других областях, связанных с изучением функционального строения белков и молекулярно-генетических систем.

УРОВЕНЬ ПРАКТИЧЕСКОЙ РЕАЛИЗАЦИИ

База данных использовалась для решения задачи поиска перспективных мишеней действия лекарственных препаратов, направленных против вируса гепатита С.

ПАТЕНТНАЯ ЗАЩИТА

Разработанная база данных прошла официальную регистрацию № 2005620266.

КОММЕРЧЕСКИЕ ПРЕДЛОЖЕНИЯ

Лицензионное соглашение.

ОРИЕНТИРОВОЧНАЯ СТОИМОСТЬ

Не рассчитывалась.

Email: salix@bionet.nsc.ru