Программное обеспечение фармакологии третьего поколения
ХАРАКТЕРИСТИКА
Компьютерная система GeneExpress2 обеспечивает доступ к информационным ресурсам, разработанным в ИЦиГ СО РАН и предназначенным для решения актуальных задач молекулярной биологии и генетики, генной инженерии, а также для разработки медико-биологических и биотехнологических приложений и подготовки специалистов в области современной биологии и биоинформатики. При разработке GeneExpress2 постоянно отслеживаются новейшие тенденции в области информационных и программных ресурсов, имеющие отношение к регуляции экспрессии генов, пространственным структурам и функциям биологических макромолекул (ДНК, РНК, белков). Иформационная система GeneExpress2 реализована на основе современных технологий Интернет-интеграции и навигации по интегрированным ресурсам. Aрхитектура GeneExpress2 обеспечивает большую информационную емкость и снабжает пользователя необходимыми средствами поддержки в виде развитой системы интерактивной помощи, комментариев и демонстрационных примеров. В GeneExpress2 интегрировано более 40 баз данных и свыше 20 пакетов программ. Каждый из пакетов содержит до нескольких десятков программ распознавания и анализа функциональных элементов биологических макромолекул и фундаментальных молекулярно-генетических процессов. Система GeneExpress2 организована с учетом естественной иерархии уровней молекулярно-генетических систем организмов, и содержит четыре крупных раздела: (1) «Уровень ДНК»; (2) «Уровень РНК»; (3) «Уровень белков»; (4) «Уровень генных сетей». GeneExpress2 относится к классу сверхбольших информационных ресурсов в области биоинформатики, является уникальной и не имеет аналогов в мире. За рубежом отсутствуют не только аналоги системы GeneExpress2 в целом, но также и аналоги большинства ее составных блоков.
ТЕХНИКО-ЭКОНОМИЧЕСКИЕ ПРЕИМУЩЕСТВА
Система GeneExpress-2 включает в себя огромное разнообразие компьютерных ресурсов, в частности, базы данных по последовательностям генов и геномов, структурно-функциональной организации генов и механизмах их регуляции; структурной организации РНК; по первичным и пространственным структурам белков; путям передачи сигналов и генным сетям, контролирующим биохимические, физиологические процессы, рост и развитие организмов, а также программы для анализа геномной ДНК различной функциональной специфичности, распознавания генов и предсказания их функции, оценки влияния мутаций на функцию регуляторных районов генов, анализа и моделирования структурно-функциональной организации РНК и белков, молекулярных взаимодействий между ними, исследования влияния мутаций на структуру и функцию ДНК, РНК и белков, программы анализа и моделирования генных сетей и метаболических процессов.
Перечисленные ресурсы обеспечивают достоверность и точность решения задач биоинформатики, существенно превосходящую современный уровень
ОБЛАСТИ ПРИМЕНЕНИЯ
Молекулярная биология, генетика, генная инженерия, биотехнология, фармакология, медицина, биоинформатика, обучение студентов высшей школы и специалистов.
УРОВЕНЬ И МЕСТО ПРАКТИЧЕСКОЙ РЕАЛИЗАЦИИ
Система готова для применения и может использоваться фармакологическими компаниями, научно-исследовательскими институтами, университетами для комплексного анализа широкого круга экспериментальных данных по цитогенетике, молекулярной биологии, молекулярной генетике, молекулярной медицине и т.д.; для проведения компьютерного анализа, направленного на выявление молекулярно-генетических дефектов изучение и моделирование механизмов возникновения генетически обусловленных патологий; молекулярного дизайна фармакологических препаратов и т.д.
ПАТЕНТНАЯ ЗАЩИТА
Разработка защищена патентами РФ:
GeneNet — патент № 990006 от 15 февраля 1999 г.
TRRD — патент № 980064 от 30 сентября 1998 г.
КОММЕРЧЕСКИЕ ПРЕДЛОЖЕНИЯ
Лицензионное соглашение
ОРИЕНТИРОВОЧНАЯ СТОИМОСТЬ
Определена будет в процессе переговоров
КОНТАКТНАЯ ИНФОРМАЦИЯ
Колчанов Николай Александрович
Доктор биологических наук
Институт цитологии и генетики
пр. акад. Лаврентьева, 10
Новосибирск, 630090, Россия
Тел.: (383) 333-34-68
Факс: (383) 333-12-78
E-mail: kol@bionet.nsc.ru
WWW: http://wwwmgs.bionet.nsc.ru/mgs/gnw