Деятельность семинара в 2013 году
Январь
Представление диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук
Генаев М.А., ведущий программист ИЦиГ СО РАН
«Разработка методов автоматического определения количественных характеристик опушения листа»
Научный руководитель: к.б.н., доцент Афонников Д.А. (ИЦиГ СО РАН)
Рецензенты: д.б.н., проф. Салина Е.А. (ИЦиГ СО РАН) и к.б.н. Лашин С.А. (ИЦиГ СО РАН).
Февраль
Представление диссертаций на соискание ученой степени кандидата биологических наук
Посух О.В., н.с. ИМКБ СО РАН
«Определение компонентов комплексов белка SUUR Drosophila melanogaster»
Научный руководитель: акад. РАН, д.б.н., проф. Жимулев И.Ф. (ИМКБ СО РАН)
Рецензенты: д.б.н., проф. Омельянчук Л.В. (ИМКБ СО РАН) и к.б.н. Шевченко А.И. (ИЦиГ СО РАН).
Омелина Е.С., м.н.с. ИЦиГ СО РАН
«Идентификация генов-мишеней транскрипционного фактора GAGA, участвующих в формировании дорзальных выростов хориона яйца Drosophila melanogaster»
Научный руководитель: к.б.н. Баричева Э.М. (ИЦиГ СО РАН)
Рецензенты: д.б.н. Демаков С.А. (ИМКБ СО РАН) и к.б.н. Федорова С.А. (ИЦиГ СО РАН).
Март
Представление диссертации на соискание ученой степени доктора биологических наук
д.б.н. Кочетов А.В., зав. лаб. генной инженерии ИЦиГ СО РАН
«Структурно-функциональная организация района инициации трансляции в мРНК эукариотических генов»
Научный консультант: академик РАН, д.б.н., проф., советник РАН Шумный В.К.
Рецензенты: д.б.н., проф. Дымшиц Г.М. (СУНЦ НГУ), д.б.н., проф. Меркулова Т.И. (ИЦиГ СО РАН) и к.б.н., доцент Матушкин Ю.Г. (ИЦиГ СО РАН).
Утверждение тем кандидатских диссертаций
Струнов А.А., аспирант ИЦиГ СО РАН
«Особенности распределения патогенного штамма wMelPop симбиотических бактерий Wolbachia в центральной нервной системе Drosophila melanogaster и его влияние на продолжительность жизни хозяина при различных температурах»
Научный руководитель: к.б.н. Киселёва Е.В. (ИЦиГ СО РАН)
Соловьев В.И., аспирант ИЦиГ СО РАН
«Изучение изоляции, дивергенции и интрогрессии некоторых чешуекрылых (Lepidoptera) Голарктики с использованием генов СОI и гистона Н1″
Научный руководитель: к.б.н., доцент Костерин О.Э. (ИЦиГ СО РАН)
Утверждение отчета за 2012 г. по индивидуальному молодежному проекту
к.б.н. Мензоров А.Г., н.с. ИЦиГ СО РАН
«Направленная дифференцировка фибробластов в серотонин- и дофаминергические нейроны для создания нейронных сетей in vitro»
Апрель
Представление диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук
Брошков А.Д., стар.лаб. ИЦиГ СО РАН, инж. НГУ
«Дивергенция последовательностей дисков политенных хромосом у видов рода Chironomus (Diptera, Chironomidae) из цитокомплекса « pseudothummi»»
Научный руководитель: д.б.н., проф. Кикнадзе И.И. (ИЦиГ СО РАН)
Рецензенты: д.б.н., проф. Бородин П.М. (ИЦиГ СО РАН) и д.б.н., проф. Сергеев М.Г. (ИСиЭЖ СО РАН).
Научный доклад
к.б.н. Дементьева Е.В.
«Изучение синдрома удлиненной QT-фазы сердечного ритма на основе пациент-специфичных индуцированных плюрипотентных стволовых клеток»
Май
Утверждение темы кандидатской диссертации
Климов Л.О., аспирант ИЦиГ СО РАН «Функция генов ренин-ангиотензиновой системы мозга при развитии артериальной гипертонии у крыс линии НИСАГ» Научный руководитель: д.б.н., проф. Маркель А.Л. (ИЦиГ СО РАН)
Промежуточные отчеты к.б.н. Горячковской Т.Н. по выполнению 1-го этапа научно-исследовательских работ по государственным контрактам
№ 14.512.11.0065 «Разработка новых биокаталитических процессов для промышленного применения»
№ 14.512.11.0050 «Создание методов метаболической инженерии термофильных микроорганизмов для получения штаммов-продуцентов молочной кислоты»
№ 14.512.11.0057 «Разработка методов генетической модификации термофильных микроорганизмов с целью создания термоустойчивых штаммов-продуцентов, предназначенных для трансформации сахаров из возобновляемых источников биомассы в биоэтанол»
Июнь
Выборы кандидатов в Ученый Совет
Утверждение темы кандидатской диссертации
Дьяков М.С., аспирант ИЦиГ СО РАН «Статистические методы и программный пакет для множественного QTL анализа в расширенных диаллельных скрещиваниях панели рекомбинантных линий и второго поколения их линий-основателей»
Научный руководитель: к.б.н., с.н.с. (доцент) Осадчук А.В. (ИЦиГ СО РАН)
Представление диссертации на соискание степени кандидата биологических наук
Струнов А.А., аспирант ИЦиГ СО РАН «Распределение бактерий Wolbachia патогенного штамма wMelPop в центральной нервной системе Drosophila melanogaster и их влияние на продолжительность жизни хозяина при различных температурах»
Научный руководитель: к.б.н. Киселёва Е.В (ИЦиГ СО РАН)
Рецензенты: д.б.н., проф. Высоцкая Л.В., НГУ д.б.н., проф. Омельянчук Л.В., ИМКБ СО РАН
Июль
Представление диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук
Малахин И.А., аспирант ИЦиГ СО РАН (окончание аспирантуры)
Тема: “Экспериментальный анализ процессов, участвующих в изменении синаптической эффективности”
Научный руководитель: д.б.н. Ратушняк А.С., Конструкторско-технологический институт вычислительной техники СО РАН
Рецензенты:
к.б.н., доцент Афонников Д.А., ИЦиГ СО РАН
д.б.н. Гришин О.В., НИИ Физиологии СО РАМН
Август
Утверждение темы кандидатской диссертации
Ахметова К.А., аспирант ИЦиГ СО РАН
«Структура и функции септина, кодируемого геном peanut Drosophila melanogaster»
Научный руководитель: к.б.н. Федорова С.А., ИЦиГ СО РАН
Сайк О.В., аспирант ИЦиГ СО РАН
«Выявление ассоциативных связей между заболеваниями и генетической регуляцией метаболических процессов на основе автоматического анализа текстов и баз данных»
Научный руководитель: к.б.н., доцент Иванисенко В.А., ИЦиГ СО РАН
Новоселова Е.С., аспирант ИЦиГ СО РАН
«Математическое моделирование транспорта ауксина в инициалях сосудистой системы корня Arabidopsis thaliana L.»
Научный руководитель: д.б.н., доцент Лихошвай В.А., ИЦиГ СО РАН
Представление диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук
Медведев К.Е., аспирант ИЦиГ СО РАН (окончание аспирантуры)
«Компьютерное исследование влияния высокого давления и температуры на структуру и функцию РНК-связывающего белка семейства Nip7 архей»
Научный руководитель: к.б.н., доцент Афонников Д.А., ИЦиГ СО РАН
Рецензенты:
к.б.н. Бакулина А.Ю., ФГУН ГНЦ ВБ «Вектор»
д.ф.-м.н., профессор Чекмарев С.Ф., Институт Теплофизики СО РАН
Дьяков М.С., аспирант ИЦиГ СО РАН (окончание аспирантуры)
«Статистические методы и программный пакет для множественного QTL анализа в расширенных диаллельных скрещиваниях панели рекомбинантных линий и второго поколения их линий-основателей»
Научный руководитель: к.б.н., с.н.с. (доцент) Осадчук А.В., ИЦиГ СО РАН
Рецензенты:
к.б.н., с.н.с. (доцент) Матушкин Ю.Г., ИЦиГ СО РАН
д.б.н. Куликов А.В., ИЦиГ СО РАН
Соловьев В.И., аспирант ИЦиГ СО РАН (окончание аспирантуры)
«Изучение изоляции, дивергенции и интрогрессии чешуекрылых родов Eversmannia, Oreta, Limenitis, Leptidea с использованием молекулярных маркеров»
Научный руководитель: к.б.н. Костерин О.Э., ИЦиГ СО РАН
Рецензенты:
к.б.н. Блинов А.Г., ИЦиГ СО РАН,
к.б.н. Шеховцов С.В., ИЦиГ СО РАН
Научные доклады
к.ф.-м.н. Фомин Э.С. (на соискание звания доцента)
«Развитие методов высокопроизводительного моделирования структуры, динамики и ЯМР-спектров для анализа взаимодействий биологических макромолекул»
к.б.н. Орлов Ю.Л. (на соискание звания доцента)
«Исследование сложности генетических текстов и поиск закономерностей в базах данных»
д.б.н. Дианов Г.Л.
«Клеточные механизмы детекции поврежденной ДНК и регуляции процессов репарации и репликации »
Сентябрь
Представление диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук
Сайк О.В., аспирант ИЦиГ СО РАН (окончание аспирантуры)
«Выявление ассоциативных связей между заболеваниями и генетической регуляцией метаболических процессов на основе автоматического анализа текстов и баз данных»
Научный руководитель: к.б.н., доцент Иванисенко В.А., ИЦиГ СО РАН
Рецензенты:
д.б.н., профессор Мошкин М.П., ИЦиГ СО РАН;
к.б.н., доцент Афонников Д.А., ИЦиГ СО РАН.
Новоселова Е.С., аспирант ИЦиГ СО РАН (окончание аспирантуры)
Тема: «Математическое моделирование транспорта ауксина в инициалях сосудистой системы корня Arabidopsis thaliana L.»
Научный руководитель: д.б.н., доцент Лихошвай В.А., ИЦиГ СО РАН
Рецензенты:
к.б.н. Акбердин И.Р., ИЦиГ СО РАН;
к.б.н. Лашин С.А., ИЦиГ СО РАН.
Научные доклады
к.б.н. Баттулин Н.Р.
Об исследовании трехмерной организации генома эукариот.
По результатам доклада рассмотрен вопрос о формировании молодежного сектора организации генома стволовых клеток.
профессор Кравченко В.В., The Scripps Research Institute, La Jolla, CA
«C12: The Oil on the SPHINGOFire that alters NFkB and ER stress signaling to prevent Cancer»
Отчеты по грантам
Грант Минобрануки РФ № 8095 от 23.07.2012 г. ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009 – 2013 годы «Исследование трехмерной организации генома половых и соматических клеток методом Hi-C» за 2013 год.
Докладчик: к.б.н. Баттулин Н.Р.
Грант Минобрануки РФ № 8740 от 01.10.2012 г. ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009 – 2013 годы «Интегрированная биоинформационная платформа анализа данных экспрессии генов в тканях мозга» за 2013 год.
Докладчик: м.н.с. Медведева И.В.
Инициативный молодежный проект «Экспериментально-теоретическое изучение роли ауксина в развитии корня A.thaliana»
Докладчик: к.б.н. Миронова В.В.
Октябрь
Представление диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук
Пономаренко П.М., аспирант ИЦиГ СО РАН (окончание аспирантуры)
«Компьютерный анализ сродства ТАТА-связывающего белка к ассоциированным с патологиями аллельным вариантам ТАТА боксов промоторов генов человека»
Научный руководитель: академик РАН, профессор, д.б.н. Колчанов Н.А., директор ИЦиГ СО РАН
Рецензенты:
к.б.н., Акбердин И.Р., ИЦиГ СО РАН;
к.б.н. Ощепков Д.Ю., ИЦиГ СО РАН.
Сормачева И.Д., м.н.с. лаборатории молекулярно-генетических систем ИЦиГ СО РАН
«Эволюция и распространение мобильных генетических элементов в геномах представителей отряда Lepidoptera»
Научный руководитель: к.б.н. Блинов А.Г., ИЦиГ СО РАН
Рецензенты:
к.б.н., доцент Афонников Д.А., ИЦиГ СО РАН;
д.б.н., профессор Бугров А.Г., НГУ и Институт систематики и экологии животных СО РАН
Научный доклад
«Positive experience of adult stem cells application in animals and humans»
Докладчики:
Dra, Prof.ra Ирина Керкис, Директор Лаборатории Генетики Института Бутантан, Сан Пауло, Бразилия
и
Dr.,Prof. Александр Керкис, Научный Консультант Центр Клеочной Терапии животных «REGENERA » и Центр Кригении стволовых клеток «CCB», Сан Пауло, Бразилия
Ноябрь
Утверждение темы кандидатской диссертации
Кожевникова О.С., м.н.с. сектора молекулярных механизмов старения ИЦиГ СО РАН
Тема: «Изменения транскриптома сетчатки крыс OXYS с возрастом при развитии ретинопатии»
Научный руководитель: д.б.н., профессор Колосова Н.Г., ИЦиГ СО РАН
Представление диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук
Кожевникова О.С., м.н.с. сектора молекулярных механизмов старения ИЦиГ СО РАН
«Выявление молекулярных механизмов развития ретинопатии у крыс OXYS»
Научный руководитель: д.б.н., профессор Колосова Н.Г., ИЦиГ СО РАН
Рецензенты:
д.б.н., профессор Меркулова Т.И., ИЦиГ СО РАН;
д.б.н., профессор Гришанова А.Ю., ИМБиБ СО РАМН
Медведева И.В., м.н.с. центра нейробиологии и нейрогенетики мозга ИЦиГ СО РАН
«Компьютерный анализ закономерностей кодирования функциональных сайтов белков в генах эукариот»
Научный руководитель: к.б.н., доцент Иванисенко В.А., ИЦиГ СО РАН
Рецензенты:
к.б.н., доцент Кочетов А.В., ИЦиГ СО РАН;
к.б.н. Орлов Ю.Л., ИЦиГ СО РАН.
Декабрь
Утверждение темы докторской диссертации
к.б.н. Орлов Ю.Л.
«Полногеномный компьютерный анализ распределения сайтов связывания транскрипционных факторов эукариот по данным иммунопреципитации хроматина и высокопроизводительного секвенирования»