Деятельность семинара в 2011 году — Федеральный исследовательский центр

Январь

Представление диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук Стефанова Н.А., м.н.с. ИЦиГ СО РАН «Автоматическая реконструкция ассоциативных генных сетей: статистическая оценка специфичности ассоциативных сетей к целевым биологическим процессам» Научный руководитель: к.б.н. Иванисенко В.А. (ИЦиГ СО РАН) Рецензенты: д.б.н., профессор Маркель А.Л. (ИЦиГ СО РАН) и д.б.н. Амстиславская Т.Г. (ИЦиГ СО РАН).
Презентация

Утверждение темы кандидатской диссертации

Тийс E.С., аспирант ИЦиГ СО РАН «Автоматическая реконструкция ассоциативных генных сетей: статистическая оценка специфичности ассоциативных сетей к целевым биологическим процессам» Научный руководитель: к.б.н., доцент Иванисенко В.А. (ИЦиГ СО РАН)

Февраль

Представление диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук Муралёва Н.А., м.н.с. ИЦиГ СО РАН «Патогенетические аспекты развития остеопороза у крыс линии OXYS и эффективность его лечения бисфосфонатами» Научный руководитель: д.б.н. Колосова Н.Г. (ИЦиГ СО РАН) Рецензенты: д.м.н. Ким Е.Б. (НЦКЭМ СО РАМН) и к.б.н. Рыкова В.И. (ИЦиГ СО РАН).

Утверждение тем кандидатских диссертаций

Иванисенко Т.В., аспирант ИЦиГ СО РАН «Автоматическая реконструкция ассоциативных генных сетей: интеграция подходов анализа текстов и предсказания белок-лиганд взаимодействий»
Научный руководитель: акад. РАН, д.б.н., проф. Колчанов Н.А. (ИЦиГ СО РАН)

Брагин А.О., аспирант ИЦиГ СО РАН «Компьютерный анализ связи конформационных пептидов с функциями и аллергенными свойствами белков»
Научный руководитель: к.б.н., доцент Иванисенко В.А. (ИЦиГ СО РАН)

Генаев М.А., аспирант ИЦиГ СО РАН «Разработка алгоритмов автоматического определения морфологии опушения растений и система для их массового применения на примере пшеницы»
Научный руководитель: к.б.н., доцент Афонников Д.А.(ИЦиГ СО РАН)

Март

Представление диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук Ведерников В.Е., м.н.с. ИЦиГ СО РАН «Выявление, количественное определение и генотипирование вируса гепатита С методом Real-time PCR»
Научный руководитель: д.б.н., профессор Дымшиц Г.М. (ИЦиГ СО РАН)
Рецензенты: д.б.н. Мордвинов В.А. (ИЦиГ СО РАН) и к.б.н., доцент Кочетов А.В. (ИЦиГ СО РАН).

Утверждение тем кандидатских диссертаций

Генаев М.А., аспирант ИЦиГ СО РАН » Разработка методов автоматического определения количественных характеристик опушения листа »
Научный руководитель: к.б.н., доцент Афонников Д.А. (ИЦиГ СО РАН)

Джетыбаев И.Е., аспирант ИЦиГ СО РАН «Молекулярнo-цитогенетический анализ путей и механизмов кариотипической эволюции саранчовых»
Научные руководители: д.б.н., проф. Рубцов Н.Б. (ИЦиГ СО РАН) и д.б.н., доцент, профессор Бугров А.Г. (НГУ)

Алемасов Н.А., аспирант ИЦиГ СО РАН «Разработка методов эффективного распараллеливания алгоритмов молекулярной динамики для процессоров архитектуры: IBM Cell, IBM Power7 и nVIDIA CUDA»
Научный руководитель: акад. РАН, д.б.н., проф. Колчанов Н.А. (ИЦиГ СО РАН)

Апрель

Представление диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук

Рогачев В.А., м.н.с. ИЦиГ СО РАН «Интернализация экзогенной ДНК в клетках культуры клеток аденокарциномы молочной железы человека MCF-7 и ее участие в процессе восстановления активности гена каспазы-3»
Научный руководитель: д.б.н. Богачев С.С. (ИЦиГ СО РАН)
Рецензенты: д.б.н., проф. Омельянчук Л.В. (ИЦиГ СО РАН) и к.б.н. Елисафенко Е.А. (ИЦиГ СО РАН).

Презентация

Утверждение тем кандидатских диссертаций

Долгова Е.В., аспирант ИЦиГ СО РАН » Токсический эффект синергичного воздействия цитостатика циклофосфана и экзогенной ДНК на организм мышей »
Научный руководитель: д.б.н. Богачев С.С. (ИЦиГ СО РАН)

Алямкина Е.А., аспирант ИЦиГ СО РАН » Исследование влияния препарата фрагментированной экзогенной ДНК на развитие экспериментальных опухолей мыши и на активацию антиген-презентирующих дендритных клеток in vivo и ex vivo »
Научный руководитель: д.б.н. Богачев С.С. (ИЦиГ СО РАН)

Май

Представление диссертаций на соискание ученой степени кандидата биологических наук

Николаев С.В., н.с. ИЦиГ СО РАН «Моделирование регуляции структуры ниши стволовых клеток в апикальной меристеме побега Arabidopsis thaliana»
Научный руководитель: Акад РАН, д.б.н., проф. Колчанов Н.А. (ИЦиГ СО РАН)
Рецензенты: д.ф.-м.н., проф. Фадеев С.И. (ИМ СО РАН) и к.б.н., доцент Кочетов А.В. (ИЦиГ СО РАН).

Презентация

Горячковская Т.Н., н.с. ИЦиГ СО РАН «Абляция ДНК под воздействием терагерцового излучения лазера на свободных электронах для молекулярно-генетических исследований»
Научный руководитель: к.б.н. Пельтек С.Е. (ИЦиГ СО РАН)
Рецензенты: д.б.н., проф. Меркулова Т.И. (ИЦиГ СО РАН) и д.б.н., доцент Солёнов Е.И. (ИЦиГ СО РАН).

Презентация

Марковец А.М., аспирант ИЦиГ СО РАН «Возрастные изменения экспрессии генов VEGF и PEDF при развитии дистрофии сетчатки»
Научный руководитель: д.б.н. Колосова Н.Г. (ИЦиГ СО РАН)
Рецензенты: д.б.н., проф. Маркель А.Л. (ИЦиГ СО РАН) и д.б.н., проф. Гришанова А.Ю. (ИЦиГ СО РАН).

Презентация

Утверждение тем кандидатских диссертаций

Зубаирова У.С., аспирант ИЦиГ СО РАН «Компьютерное моделирование морфодинамики в меристемах растений с учётом морфогенетической регуляции и биомеханических свойств клеток»
Научный руководитель: Акад РАН, д.б.н., проф. Колчанов Н.А. (ИЦиГ СО РАН)

Лощенова П.С., аспирант ИЦиГ СО РАН «Соматический мутагенез митохондриальной ДНК гиппокампа в процессе старения крыс линий Wistar и OXYS»
Научный руководитель: к.б.н. Синицина О.И. (ИЦиГ СО РАН)

Июнь

Представление диссертаций на соискание ученой степени кандидата биологических наук

Тийс Е.С., аспирант ИЦиГ СО РАН «Автоматическая реконструкция ассоциативных генных сетей: статистическая оценка специфичности ассоциативных генных сетей к целевым биологическим процессам»
Научный руководитель: к.б.н., доцент Иванисенко В.А. (ИЦиГ СО РАН)
Рецензенты: к.б.н. Акбердин И.Р. (ИЦиГ СО РАН) и к.б.н. Ананько Е.А. (ИЦиГ СО РАН).

Малахова А.А., м.н.с. ИЦиГ СО РАН «Центр инактивации Х-хромосомы обыкновенных полевок: характеристика последовательностей ДНК и анализ экспрессии генов»
Научный руководитель: д.б.н., проф. Закиян С.М. (ИЦиГ СО РАН)
Рецензенты: д.б.н., проф. Высоцкая Л.В. (НГУ) и к.б.н. Ромащенко А.Г. (ИЦиГ СО РАН).

Презентация

Рогачев В.А., м.н.с. ИЦиГ СО РАН (повторно) «Интернализация экзогенной ДНК в клетках культуры клеток аденокарциномы молочной железы человека MCF-7 и ее участие в процессе восстановления активности гена каспазы-3»
Научный руководитель: д.б.н. Богачев С.С. (ИЦиГ СО РАН)
Рецензенты: д.б.н., проф. Омельянчук Л.В. (ИЦиГ СО РАН) и к.б.н. Елисафенко Е.А. (ИЦиГ СО РАН).

Презентация

Иванисенко Т.В., аспирант ИЦиГ СО РАН «Автоматическая реконструкция ассоциативных генных сетей на основе интеграции анализа текстов и предсказания взаимодействий белков с лигандами»
Научный руководитель: акад. РАН, д.б.н., проф. Колчанов Н.А. (ИЦиГ СО РАН)
Рецензенты: к.х.н. Мищенко Е.Л. (ИЦиГ СО РАН) и к.б.н. Орлов Ю.Л. (ИЦиГ СО РАН).

Ри М.Т., аспирант ИЦиГ СО РАН «Математическое моделирование биосинтеза нуклеотидов de novo у Escherichia coli»
Научный руководитель: д.б.н., доцент Лихошвай В.А. (ИЦиГ СО РАН)
Рецензенты: к.б.н. Акбердин И.Р. (ИЦиГ СО РАН) и к.б.н. Пономаренко М.П. (ИЦиГ СО РАН).

Алемасов Н.А., аспирант ИЦиГ СО РАН «Использование спецпроцессоров для изучения физических свойств белков методами молекулярной динамики»
Научный руководитель: акад. РАН, д.б.н., проф. Колчанов Н.А. (ИЦиГ СО РАН)
Рецензенты: к.б.н. Лашин С.А. (ИЦиГ СО РАН) и к.б.н. Пинтус С.С. (ИЦиГ СО РАН).

Утверждение темы докторской диссертации к.м.н. Николин В.П., с.н.с. ИЦиГ СО РАН «Биологические эффекты экзогенных нуклеиновых кислот»

Научный доклад
д.б.н., проф. Рубцов Н.Б. «Микроскопия наноструктур в биологических объектах» А также информация о II Международной конференции «Приоритетные направления научных исследований нанообъектов искусственного и природного происхождения» STRANN-2011

Август

Представление диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук Синякова Н.А., аспирант ИЦиГ СО РАН «Экспрессия гена il6st и функции белка gp130 у мышей с наследственной каталепсией»
Научный руководитель: д.б.н. Куликов А.В. (ИЦиГ СО РАН)
Рецензенты: д.б.н. Морозова О.В. (ИХБФМ СО РАН) и к.б.н. Воронова И.П. (НИИ Физиологии СО РАМН).

Сентябрь

Представление диссертаций на соискание ученой степени кандидата биологических наук Корчагина Р.П., аспирант ИЦиГ СО РАН «Полиморфизм генов биотрансформации ксенобиотиков (CYP2C9, CYP4F2, CYP2D6, GSTM1, GSTT1) и гена VKORC1 в популяциях коренных этносов северной Сибири»
Научный руководитель: к.б.н. Осипова Л.П. (ИЦиГ СО РАН)
Рецензенты: д.б.н., проф. Захаров И.К. (ИЦиГ СО РАН) и к.б.н. Бабенко В.Н. (ИЦиГ СО РАН).

Брагин А.О., аспирант ИЦиГ СО РАН «Компьютерный анализ связи конформационных пептидов с аллергенностью белков»
Научный руководитель: к.б.н., доцент Иванисенко В.А. (ИЦиГ СО РАН)
Рецензенты: к.б.н. Орлов Ю.Л. (ИЦиГ СО РАН) и к.б.н. Пономаренко М.П. (ИЦиГ СО РАН).

Презентация

Научные доклады

к.ф.-м.н., с.н.с. Чернышев А.В. (ИХКиГ СО РАН) «Возможности сканирующей конфокальной микроскопии в исследовании диффузионной подвижности белков в ядрах живых клеток»

к.б.н. Васильев Г.В. «Об изменениях в работе Центра секвенирования ДНК. Рекомендации сотрудников центра по решению проблем с секвенированием»

Октябрь

Обсуждение и утверждение бюджетных проектов 2013 – 2015 гг.

Представление диссертаций на соискание ученой степени кандидата биологических наук

Горячковская Т.Н., н.с. ИЦиГ СО РАН (повторно) «Абляция ДНК под воздействием терагерцового излучения лазера на свободных электронах для молекулярно-генетических исследований»
Научный руководитель: к.б.н. Пельтек С.Е. (ИЦиГ СО РАН)
Рецензенты: д.б.н., проф. Меркулова Т.И. (ИЦиГ СО РАН) и д.б.н., доцент Солёнов Е.И. (ИЦиГ СО РАН).

Презентация

Волкова О.А., м.н.с. ИЦиГ СО РАН «Трансляционно-значимые характеристики 5′-нетранслируемых районов мРНК эукариотических генов»
Научный руководитель: к.б.н., доцент Кочетов А.В. (ИЦиГ СО РАН)
Рецензенты: д.б.н., проф. Меркулова Т.И. (ИЦиГ СО РАН) и к.б.н. Матушкин Ю.Г. (ИЦиГ СО РАН).

Презентация

Утверждение темы докторской диссертации

д.б.н. Кочетов А.В., зав. лаб. генной инженерии ИЦиГ СО РАН «Сигнал инициации трансляции мРНК эукариотических генов»

Научные доклады

д.б.н. Ефимов В.М. «Комбинирование и анализ гетерогенных данных»

Семинар-презентация Компании «Ростбиохим» «Высококачественный пластик для культуральных работ и лабораторных технологий, производство Techno Plastic Products AG, Швейцария»