Деятельность семинара в 2023 году — Федеральный исследовательский центр

Деятельность семинара в 2023 году

16-ого января

Представление диссертационной работы на соискание ученой степени доктора физико-математических наук по специальности 1.2.2. — Математическое моделирование, численные методы и комплексы программ

Соискатель: к.б.н. Лашин Сергей Александрович, ведущий научный сотрудник, и.о. заведующего сектором биоинформатики и информационных технологий в генетике, ИЦиГ СО РАН

Тема: «Многоуровневые компьютерные модели эволюционных процессов»

Научный консультант: д.б.н., Колчанов Николай Александрович, профессор, академик РАН, заведующий Отделом системной биологии, ИЦиГ СО РАН

Рецензенты:

д.б.н. Щербаков Дмитрий Юрьевич, профессор, заведующий лабораторией геносистематики, ФГБУН Лимнологический институт СО РАН, г. Иркутск.

д.ф.-м.н. Марченко Михаил Александрович, профессор РАН, директор института вычислительной математики и математической геофизики СО РАН

д.ф.-м.н. Голубятников Владимир Петрович, профессор, главный научный сотрудник Института Математики СО РАН.

 

13-ого февраля

  1. Представление диссертационной работы на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности: 1.5.7. – генетика

Соискатель: Бикчурина Татьяна Игоревна, младший научный сотрудник лаборатории рекомбинационного и сегрегационного анализа, ИЦиГ СО РАН.

Тема: «Цитогенетические механизмы стерильности у гибридов между некоторыми видами семейства Хомяковые (Cricetidae)»

Научный руководитель:

д. б. н. Бородин Павел Михайлович, профессор, главный научный сотрудник Лаборатории рекомбинационного и сегрегационного анализа ИЦиГ СО РАН.

Рецензенты:

к.б.н. Фёдорова Светлана Александровна, ведущий научный сотрудник сектора генетики клеточного цикла, ИЦиГ СО РАН;

к.б.н. Проскурякова Анастасия Андреевна, младший научный сотрудник лаборатории цитогенетики животных, ИМКБ СО РАН.

  1. Представление диссертационной работы на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности: 1.5.7. – генетика

Соискатель: Решетников Василий Владимирович, младший научный сотрудник лаборатории регуляции экспрессии генов, ИЦиГ СО РАН.

Тема: «Анализ изменений транскриптома и паттерна H3K4me3 под действием раннего постнатального стресса в префронтальной коре взрослых самцов мышей».

Научный руководитель:

к. б. н. Бондарь Наталья Петровна, заведующая сектора молекулярной нейробиологии стресса ИЦиГ СО РАН.

Рецензенты:

д.б.н. Тихонова Мария Александровна, заведующая лаборатории экспериментальных моделей нейродегенеративных процессов Научно-исследовательского института нейронаук и медицины СО РАН;

к.б.н. Ланшаков Дмитрий Александрович, заведующий сектором постгеномной нейробиологии ИЦиГ СО РАН.

 

20-ого марта

Представление диссертационной работы на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности: 1.5.8. — математическая биология, биоинформатика.

Соискатель: Белокопытова Полина Станиславовна, младший научный сотрудник лаборатории структурно-функциональной организации генома, НГУ, лаборант, научно-образовательного отдела ИЦиГ СО РАН.

Тема: «Разработка и оценка точности предсказательных моделей трёхмерной укладки хроматина млекопитающих».

Научный руководитель:

к.б.н. Фишман Вениамин Семенович, заведующий сектором геномных механизмов онтогенеза, ИЦиГ СО РАН.

Рецензенты:

д.б.н. Кулаковский Иван Владимирович, Институт белка РАН, ведущий научный сотрудник группы регуляции биосинтеза белка, г. Москва;

к.ф.-м.н. Попцова Мария Сергеевна, доцент, заведующая международной лаборатории биоинформатики НИУ ВШЭ, г. Москва

д.б.н. Шидловский Юлий Валерьевич, профессор РАН, ведущий научный сотрудник, заведующий Лабораторией регуляции экспрессии генов в развитии ИБГ РАН.

 

15-го мая

  1. Утверждение темы диссертационной работы в изменённой формулировке на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 5.22. – клеточная биология (биологические науки).

Соискатель: Сульдина Любовь Александровна, м.н.с., сектора генетики промышленных микроорганизмов, ИЦиГ СО РАН

Тема в изменённой формулировке: «Влияние увеличения числа CAG повторов в гене НТТ на ультраструктурную организацию шипиковых нейронов, полученных из разных линий индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека, а также генетически-модифицированных клеток НЕК293»

Научный руководитель: к.б.н. Киселева Елена Владимировна, ведущий научный сотрудник сектора структурной биологии клетки ИЦиГ СО РАН.

  1. Представление диссертационной работы на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 1.5.22. – клеточная биология (биологические науки).

Соискатель: Риттер Генрих Сергеевич, младший научный сотрудник лаборатории высокотехнологического фенотипирования лабораторных животных — генетических моделей патологий человека, ИЦиГ СО РАН

Тема: «Изучение клеточных и молекулярных механизмов радиопротекторного действия двуцепочечной РНК Saccharomyces сerevisiae».

Научный руководитель: д.б.н. Богачев Сергей Станиславович главный научный сотрудник лаборатории индуцированных клеточных процессов, ИЦиГ СО РАН

Рецензенты:

к.б.н. Синицына Ольга Ивановна, ведущий научный сотрудник лаборатории генной инженерии, ИЦиГ СО РАН

к.б.н. Шевченко Александр Игоревич, старший научный сотрудник, лаборатории эпигенетики развития, ИЦиГ СО РАН

 

19-ого июня

  1. Утверждение темы и научного руководителя кандидатской диссертации Турнаева Игоря Ивановича Научная специальность: 1.5.7. – генетика

Тема: «Эволюция генов, кодирующих ферменты триптофан-зависимого пути биосинтеза ауксина у растений»

Научный руководитель: к.б.н. Афонников Дмитрий Аркадьевич, доцент, заведующий лаборатории эволюционной биоинформатики и теоретической генетики, ИЦиГ СО РАН.

  1. Представление диссертационной работы на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 1.5.22. – клеточная биология (биологические науки).

Соискатель: Сульдина Любовь Александровна, м.н.с., сектора генетики промышленных микроорганизмов, ИЦиГ СО РАН

Тема: “Особенности ультраструктурной организации клеток человека с увеличенным числом CAG повторов в гене НТТ, полученных от пациентов с болезнью Хантингтона или в результате генетической модификации”, утверждена на Ученом совете ИЦиГ СО РАН, Протокол №3 от 17.05.2023.

Научный руководитель: к.б.н. Киселева Елена Владимировна, ведущий научный сотрудник, сектора структурной биологии клетки, ИЦиГ СО РАН

Рецензенты:

д.б.н. Айдагулова Светлана Владимировна, профессор, зав. лабораторией клеточной биологии и фундаментальных основ репродукции Центральной научно-исследовательской лаборатории ФГБОУ ВО «Новосибирский государственный медицинский университет» МЗ РФ

к.б.н. Огиенко Анна Александровна, старший научный сотрудник лаборатории клеточного деления ИМКБ СО РАН

  1. Представление диссертационной работы на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 1.5.8. — математическая биология, биоинформатика.

Соискатель: Цуканов Антон Витальевич, м.н.с. сектора биоинформатики и информационных технологий в генетике, ИЦиГ СО РАН

Тема: “Мультимодельный подход к эффективному картированию сайтов связывания транскрипционных факторов по данным ChIP-seq экспериментов”.

Научный руководитель: к.б.н. Левицкий Виктор Георгиевич, с.н.с. лаборатории эволюционной биоинформатики и теоретической генетики.

Рецензенты:

к.б.н., Омелина Евгения Сергеевна, заведующая лабораторией клеточного деления ФГБУН, ИМКБ СО РАН

к.б.н., Колпаков Федор Анатольевич, Научный руководитель направления «Вычислительная биология», Научный центр информационных технологий и искусственного интеллекта, АНО ВО «Университет Сириус», заведующий лабораторией биоинформатики ФИЦ Информационных и вычислительных технологий; технический директор ООО «Биософт.Ру».

 

10-ого июля

1 Представление диссертационной работы на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 1.5.7. – Генетика

Соискатель: Бирюков Михаил Юрьевич, м.н.с., межинститутской лаборатории молекулярной палеогенетики и палеогеномики ИЦиГ СО РАН.

Тема: «Происхождение и эволюция структурных вариантов Тat LTR-ретротранспозонов зелёных растений»

Научный руководитель: к.б.н. Устьянцев Кирилл Валерьевич, н.с., сектора молекулярно-генетических механизмов регенерации ИЦиГ СО РАН

Рецензенты:

к.б.н. Афонников Дмитрий Аркадьевич, в.н.с., отделения «Курчатовский

геномный центр ИЦиГ СО РАН»

д.б.н. Пономаренко Михаил Павлович, в.н.с., сектора регуляторной компьютерной геномики, ИЦиГ СО РАН

  1. Представление диссертационной работы на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 1.5.8. — математическая биология, биоинформатика.

Соискатель: Цуканов Антон Витальевич, м.н.с. сектора биоинформатики и информационных технологий в генетике, ИЦиГ СО РАН

Тема: «Мультимодельный подход к эффективному картированию сайтов связывания транскрипционных факторов по данным ChIP-seq экспериментов».

Научный руководитель: к.б.н. Левицкий Виктор Георгиевич, с.н.с. лаборатории эволюционной биоинформатики и теоретической генетики.

Рецензенты:

к.б.н. Омелина Евгения Сергеевна, заведующая лабораторией клеточного деления ФГБУН, ИМКБ СО РАН

к.б.н. Колпаков Федор Анатольевич, Научный руководитель направления “Вычислительная биология”, Научный центр информационных технологий и искусственного интеллекта, АНО ВО “Университет Сириус”, заведующий лабораторией биоинформатики ФИЦ Информационных и вычислительных технологий; технический директор ООО “Биософт.Ру”.

 

31-ого июля

  1. Представление диссертационной работы на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 1.5.22. – клеточная биология (биологические науки).

Соискатель: Риттер Генрих Сергеевич, младший научный сотрудник лаборатории высокотехнологического фенотипирования лабораторных животных — генетических моделей патологий человека, ИЦиГ СО РАН

Тема: «Изучение клеточных и молекулярных механизмов радиопротекторного действия двуцепочечной РНК Saccharomyces сerevisiae».

Научный руководитель: д.б.н. Богачев Сергей Станиславович главный научный сотрудник лаборатории индуцированных клеточных процессов, ИЦиГ СО РАН

Рецензенты:

к.б.н. Синицына Ольга Ивановна, ведущий научный сотрудник лаборатории генной инженерии, ИЦиГ СО РАН

к.б.н. Шевченко Александр Игоревич, старший научный сотрудник, лаборатории эпигенетики развития, ИЦиГ СО РАН

  1. Представление диссертационной работы на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности: 1.5.7. – генетика

Соискатель: Бикчурина Татьяна Игоревна, младший научный сотрудник лаборатории рекомбинационного и сегрегационного анализа, ИЦиГ СО РАН.

Тема: «Цитогенетические механизмы стерильности у гибридов между некоторыми видами семейства Хомяковые (Cricetidae)».

Научный руководитель: д.б.н. Бородин Павел Михайлович, профессор, главный научный сотрудник Лаборатории рекомбинационного и сегрегационного анализа ИЦиГ СО РАН.

Рецензенты:

к.б.н. Фёдорова Светлана Александровна, ведущий научный сотрудник сектора генетики клеточного цикла, ИЦиГ СО РАН;

к.б.н. Проскурякова Анастасия Андреевна, младший научный сотрудник лаборатории цитогенетики животных, ИМКБ СО РАН.