Молодые учёные освоили передовые методы биоинформатики и генетики растений в ИЦиГ СО РАН
В Мультишколе SBB–PlantGen School 2026 участвовали студенты, аспиранты и молодые исследователи из разных городов России
В Институте цитологии и генетики СО РАН завершилась Мультишкола молодых ученых, объединившая 16-ю Школу молодых ученых «Системная биология и Биоинформатика» (SBB-2026) и 6-ю Школу молодых ученых «Генетика, геномика, биоинформатика и биотехнология растений» (PlantGen School 2026). На протяжении пяти дней студенты, аспиранты и молодые исследователи знакомились с современными методами генетики, биоинформатики и селекции и осваивали их на практических занятиях.
Школа собрала представителей из 13 городов России: Новосибирска, Барнаула, Благовещенска, Воронежа, Иркутска, Москвы, Нижнего Новгорода, Омска, Самары, Санкт-Петербурга, Томска, Тюмени, Уфы. Её программа включала лекции ведущих специалистов, семь практик, устные доклады и постерную сессию.
Центральным форматом школы стала практика: слушатели не только обсуждали исследовательские подходы, но и знакомились с программами, экспериментальными протоколами и биологическими объектами. Темы охватывали анализ геномных данных, моделирование биомолекул, регуляцию экспрессии генов и технологии генетики растений.
На одной из практик участники учились реконструировать и анализировать генные сети в программе ANDVisio компьютерно-информационной системы ANDSystem. Такой подход помогает перейти от сведений об отдельных молекулах к пониманию их взаимодействий.
«Генные сети позволяют объединить информацию об отдельных молекулярно-генетических взаимодействиях между генами, белками, метаболитами и другими объектами в целостную картину», – пояснила младший научный сотрудник сектора биоинформатики и информационных технологий в генетике ИЦиГ СО РАН Анна Адамовская.
Другие занятия были посвящены ChIP-seq – методу картирования участков генома, связанных с определёнными регуляторными белками, – и выявлению генетических вариаций по данным полногеномного секвенирования. На трёхдневной практике по доставке генетических конструкций участники осваивали протоколы, необходимые для трансформации и последующего редактирования генома растений.
Отдельное направление составили технологии удвоенных гаплоидов, позволяющие ускорять селекцию за счёт получения полностью гомозиготных линий. Лекцию и практические занятия проводила научный сотрудник лаборатории молекулярной генетики и цитогенетики растений ИЦиГ СО РАН, кандидат биологических наук Екатерина Тимонова. По её словам, в России такие технологии пока используют немногие научные и селекционные центры, хотя потребность в современных инструментах растёт.
«Окружающая среда стала меняться очень быстро, и от нас потребуется решать задачи селекции новых сортов, адаптированных к последствиям этих изменений», – отметила Екатерина Тимонова. Она подчеркнула, что занятия дают прежде всего первое знакомство с методом. Однако и этого может быть достаточно, чтобы исследователь оценил его возможности и решил освоить технологию для собственной работы.
Связь научных методов с прикладными задачами показали и представители высокотехнологичного бизнеса, которые традиционно помогают в проведении школы. В этом году спонсорами мероприятия выступили такие компании, как ООО «Диаэм», ООО «Феномика», ООО «Компания Хеликон» и ООО «СкайДжин».
Представители бизнеса подготовили для слушателей школы не только выставочные экспозиции, но и ряд докладов. Так, технический директор ООО «Феномика» Максим Патрин выступил с лекцией «Феномная селекция растений. Обзор технологий и действующие решения в России». Он рассказал об отборе растений по множеству наблюдаемых признаков и технологиях, которые могут дополнить геномную селекцию.
«Хочется познакомить своих коллег с теми технологиями, с которыми мы сами работаем. Может быть, они увидят, что эти подходы будут эффективными для их исследовательской деятельности», – рассказал Максим Патрин.
Основу лекционной программы составили выступления ведущих российских ученых про математические и компьютерные модели эволюции, функциональную генетику сои, геномное редактирование растений, нанопоровое секвенирование на платформе Polyseq Biotech и применение искусственного интеллекта в компьютерной эпидемиологии.
Завершилась Школа подведением итогов конкурса докладов молодых учёных. Первое место среди устных докладов получила Мария Гавриленко из Томского НИМЦ за работу «Анализ альтернативного сплайсинга в децидуальных клетках плаценты при преэклампсии на основе rMATS». Лучший постер представила Анна Скотарева из ИХБФМ СО РАН – «Резистом и мобилом почвенных микробиомов агроэкосистем Западной Сибири: метагеномный анализ». Конкурс объединил исследования в области биомедицины, микробиологии, генетики и сельского хозяйства, отразив междисциплинарный характер программы. С полным списком победителей и другой информацией можно ознакомится на сайте школы — https://conf.icgbio.ru/sbb-plantgen-2026/contest-results/
Пресс-служба Института цитологии и генетики СО РАН
Фото из архива пресс-службы ИЦиГ СО РАН